怎样在NCBI上进行16S序列的比对
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/20 18:12:05
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C
粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
首先打开NCBI网站首页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的基因序列名称,点击search就行.然后会出来很多结果,因为很多基因是同名的,或是一个基因在不同种属中不一样
除非你的猪的品种很特别,一般查已知的克隆出来的猪的基因就行了,很保守的出现突变或差异的概率很小,如果是扩这段基因的话直接找一个就行,没多大差异,克隆出来了再去测序就知道不同品种间的差异了.
举个例子吧.搜索GI号为386311839的蛋白质进入NCBI主页,选择Protein数据库,输入GI号,点击search然后就OK了.
先查胰蛋白酶和棉铃虫英语怎么说,再打开NCBI,会看到搜索栏,搜索栏的前面一小栏是选择你查找的类别,比如是蛋白质还是基因,你这个选择gene就行,再在后面输入胰蛋白酶(要输英文名哦),这时候会出来好多
首先,向NCBI提交序列后,会有专门人员进行初步筛选,把那些有明显错误的序列筛除.剩下的是无明显错误的序列.其次,这些NCBI里的序列不可能全是正确的,有很多也是错误的,只是初筛时未发现这些错误.最后
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
1、进入NCBI主页,在下拉框中选择GENE,然后输入p53,点击进入,出现摘要页面,选择物种Musmusculus(在右边物种栏),更新摘要页面,选择你想要的基因,点击后进入基因的报告页面,点击右侧
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
百度EZTaxon,进去之后注册,登录,左边IdentifyStep1在空白处按照如下格式输入>序列名称(自己写,能认识就行)序列(测序结果,只含ATCG)如:>E.coliATCGATCG...St
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始
哪一个转录因子?不同的基因有不同的序列,转录因子也是某些基因表达的某类蛋白,只是这些蛋白能够结合到其他基因的转录调控区域(如启动子),从而调节其他基因的转录.作为某个特定的转录因子,必须明确它的名称(
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
KEGG网站更容易,输入基因名,点击othorloggenes查看下拉框即可再问:不行没查到可能是我也不会操作吧再答:1、NCBI选择nucleotide,输入基因名,获得该基因某物种的序列。如果已经
你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问:下面一大块的都是