NCBI-nr database 与NCBI
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/08/15 04:53:05
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在Genbank中,每条登陆上传的核酸序列都有一个唯一的ID号,可以凭借此ID迅速找到该核酸序列.
1、打开NCBI的主页2、在Search后面的第一个框内选择Nucledite3、在第二个框内输入你所要寻找的菌株名称4、点击Go5、在结果中过滤你需要的基因6、打开该搜索结果即可在最底部看到基因序列
NCBI(美国国家生物技术信息中心)NCBI的主要任务是发展新的信息学技术,来帮助对那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程的理解.
gi是序列(如gene,protein,mRNA...)存入NCBI数据库时顺序assign的一个数字,便于database管理和监控.值得注意的是gi和基因编号(geneID)无关,后者是针对每个基
Lineage里记录的信息是某个物种的分类地位,即它属于哪个门,哪个纲等等逐级说明.如:人的lineage:cellularorganisms;Eukaryota;Opisthokonta;Metaz
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
你说的应该是野猪(Susscrofa)的基因组从以下链接的图中可以看到complement那段说的就是一个基因名字为LOC100622239,这个基因的特点就是,相对GUCY1A3而言,它是向另一个方
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/关于Blast的文章:http://liucheng.name/tag/blast/
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据
1,如果你知道基因名称的话,进入NCBI主页,在选项后面选择GENE然后输入你要查找的基因名称.2,如果你知道基因序列的编号,选择NECLEOTID然后输入你的序列ID即可3如果你知道有关基因的部分信
PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如
向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin.用那种办法,根据不同的需要.BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.g
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中
选核苷酸那个nucleotide在basicblast里面再问:请问是nucleotidecollection,选择这个对吗?还有blast之后,要建树嘛,怎么选择同源性菌株呢?再答:嗯对的建树时同源
你登记账户后,这个栏目下可以保存你的检索记录,包括文献,序列等等.
哪一个转录因子?不同的基因有不同的序列,转录因子也是某些基因表达的某类蛋白,只是这些蛋白能够结合到其他基因的转录调控区域(如启动子),从而调节其他基因的转录.作为某个特定的转录因子,必须明确它的名称(
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/,是一个基因库,可以查询已知序列,还可以查找文章,登记序列等等,不管是筛选细菌还是做分子实验,都是很有用的网站
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用