NCBI上提取mRNA序列方法
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/08/17 06:41:21
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正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
在NCBI的点击 Pub Med,在后面输入你要查询的相应的基因的名称,就会把所有NCBI登记在案的mRNA序列显示出来了,包括很多物种的,
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
ncbi上面有那个具体的网页很容易找的你确定改片段的名称以及物种就可以
直接查基因序列就行啊,查什么mRNA啊.直接搜WheatwrkyTranscriptionfactor,找到14条GENE,选你想要的打开连接,里面有Relatedsequences这一项,里面有基因
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov,上面搜索条,下拉菜单选gene,后面输入你要找的基因名,加种属名,如人的加homo,点search,选择你要的基因进入,里面有详细介绍,下拉
在genbank中搜索cytochromeCmRNA,应该可以,不过最好再多几个关键词,比如哪个物种
首先,向NCBI提交序列后,会有专门人员进行初步筛选,把那些有明显错误的序列筛除.剩下的是无明显错误的序列.其次,这些NCBI里的序列不可能全是正确的,有很多也是错误的,只是初筛时未发现这些错误.最后
找到一个物种的mRNA序列,用mRNA的序列去进行blast,找同源性高的序列,找不同物种的.就可以了
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
很基础的问题啊,在NCBI上search:gene,下面的对话框输入你要找的基因的名称,会出来相关的基因序列,看你要找什么物种的,一般是人和鼠的,如人的后缀是Homosapiens,鼠的是Musmus
NCBI上一般不会有说明,你需要近其他预测信号肽的网站进行分析比如:
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取.NCBI的GenBank提供了两个投递方式:1、在线投递-BankIt,特点是比较方便.2、本地投递文件生
因为NCBI是按模板链给的,毕竟基因间的比对用得较多,改成U太麻烦,你自己知道mRNA中T应该是U就好了
ncbi序列既有cDNA序列也有mRNA序列,一般会有注释的.如果已经说明是mRNA就不可能是cDNA.mRNA是以正义链的形式给出的,所以是T而不是U.这可能是因为序列提交者一般只对DNA测序,而很
如果你在NCBI查到一个基因,在summary栏目的下面紧接着就是一个叫做“Genomicregions,transcripts,andproducts”的栏目,是一个图,左侧有蓝色的小字“NM_……