ncbi上猪的基因组序列下载地址
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/08/17 05:21:00
![ncbi上猪的基因组序列下载地址](/uploads/image/f/717145-25-5.jpg?t=ncbi%E4%B8%8A%E7%8C%AA%E7%9A%84%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%BA%8F%E5%88%97%E4%B8%8B%E8%BD%BD%E5%9C%B0%E5%9D%80)
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
怎么会没有.自己看清楚点.有个“sendto”的下拉框.选“sendtofile”就是下载咯
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
简单说一下如何查找基因,首先你要知道这个酶是人源的还是鼠源或是你需要检索的其他物种,登陆NCBI,在检索框中直接搜索基因名字,会出现关于这个基因的所有信息,你要是只想要基因序列就选择里面的Nucleo
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov,上面搜索条,下拉菜单选gene,后面输入你要找的基因名,加种属名,如人的加homo,点search,选择你要的基因进入,里面有详细介绍,下拉
除非你的猪的品种很特别,一般查已知的克隆出来的猪的基因就行了,很保守的出现突变或差异的概率很小,如果是扩这段基因的话直接找一个就行,没多大差异,克隆出来了再去测序就知道不同品种间的差异了.
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
直接用关键词Homosapiensmitochondrion在genome数据库中搜索就行了.找completegenome这是找到的.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/site
这个应该去GenBank不应该到NCBI吧~再问:貌似您不总用NCBI啊.....(还有一件不太重要的事......NCBI里就包括GenBank,不重要了不过)GenBank也可以凑合了......
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
基因的全序列是么?OK进入NCBI,选中mapview选择项.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/输入你要下载的基因名称和物种.举个例子,我要下载小鼠的IGF2基因
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始
打开NCBI网站,在search中选择Nucleotide核酸序列,后面输入你想找序列的拉丁文,搜索,点击序列,选着fasta格式,在上方中间位置send选择file,createfile就下载下来了
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
提取该物质总RNA做反转录获得cDNA后合成双链根据同源物种的该基因序列设计引物(简并引物)PCR扩增得到目的片段(可能会用到巢式PCR增加特异性)切胶回收纯化质粒载体连接转染筛选获得重组子测序得基因
第二条结果.查找方式:选择GenomeProject,查找arabidopsisthaliana
按编码功能分:蛋白质编码序列;rRNA基因、tRNA基因等RNA编码基因;基因间隔区序列、重复序列等非编码序列;其它功能序列,如复制起点、端粒区、转座子元件等.