请问怎么用SWISS-MODEL预测蛋白质三级结构,页面英文看不懂啊,
来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/31 09:34:31
请问怎么用SWISS-MODEL预测蛋白质三级结构,页面英文看不懂啊,
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![](http://img.wesiedu.com/upload/f/7f/f7fb8cbd4f1e7a6223879df2cd7c7e71.jpg)
选取Modeling中Automated Mode
![](http://img.wesiedu.com/upload/d/e1/de143b669f5f491beb368599b26da1ed.jpg)
在页面上输入你的邮箱(用于接受结果),待分析蛋白质序列(最好是fasta格式)或AC号
也可以直接输入PDB数据库中的ID号
![](http://img.wesiedu.com/upload/d/de/dde9ed82a2bbaa1639fec1709d3b7656.jpg)
我以序列
>query_prot
DVNMKLTGRIMDAAKEVDHTCRSSTGVPRDMLHRYAEGQTVDDDDFKCYLKCIMVEFNSLSDDGVFVLEEELENVPPEIKEEGHRVVHSCKHINHDEACETAYQIHQCYKQSDPELYSLVVRAFDATIGD
为例,按上述操作得到结果(需要等一段时间,甚至会有好几分钟)为
![](http://img.wesiedu.com/upload/0/ac/0ac203dfc71f1f852f21949aeca0af85.jpg)
![](http://img.wesiedu.com/upload/9/9c/99c548ecdcafca2561ecc0aad4ece332.jpg)
(以上为不完全截图,结果页面链接为http://swissmodel.expasy.org/workspace/index.php?func=workspace_modelling&userid=xucongtys@163.com&token=TOKEN&key=11525fa82165c40ee6884048a459d9c9&prjid=P000008)即得到三级预测结果,从结果页面可得到所用模板的PDB ID号,可将结果用pdf格式保存
(PS:会收到一封邮件,提供结果链接,可保存下来以后直接查看结果)
![](http://img.wesiedu.com/upload/c/13/c13df02986c336bb8e9976fb75b65584.jpg)
【以上结果仅供参考,要求不同所用模式也有差别,我这里提供的是一种最基础的方法,希望对大家有所帮助】
![](http://img.wesiedu.com/upload/f/7f/f7fb8cbd4f1e7a6223879df2cd7c7e71.jpg)
选取Modeling中Automated Mode
![](http://img.wesiedu.com/upload/d/e1/de143b669f5f491beb368599b26da1ed.jpg)
在页面上输入你的邮箱(用于接受结果),待分析蛋白质序列(最好是fasta格式)或AC号
也可以直接输入PDB数据库中的ID号
![](http://img.wesiedu.com/upload/d/de/dde9ed82a2bbaa1639fec1709d3b7656.jpg)
我以序列
>query_prot
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为例,按上述操作得到结果(需要等一段时间,甚至会有好几分钟)为
![](http://img.wesiedu.com/upload/0/ac/0ac203dfc71f1f852f21949aeca0af85.jpg)
![](http://img.wesiedu.com/upload/9/9c/99c548ecdcafca2561ecc0aad4ece332.jpg)
(以上为不完全截图,结果页面链接为http://swissmodel.expasy.org/workspace/index.php?func=workspace_modelling&userid=xucongtys@163.com&token=TOKEN&key=11525fa82165c40ee6884048a459d9c9&prjid=P000008)即得到三级预测结果,从结果页面可得到所用模板的PDB ID号,可将结果用pdf格式保存
(PS:会收到一封邮件,提供结果链接,可保存下来以后直接查看结果)
![](http://img.wesiedu.com/upload/c/13/c13df02986c336bb8e9976fb75b65584.jpg)
【以上结果仅供参考,要求不同所用模式也有差别,我这里提供的是一种最基础的方法,希望对大家有所帮助】