直接测序检测SNP与疾病的相关性,到底该用多少多少样本啊?请有经验的高手指教
来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/16 17:26:15
直接测序检测SNP与疾病的相关性,到底该用多少多少样本啊?请有经验的高手指教
或者推荐一些关于直接测序的文献,
可惜我已经不能送分给您了!
我想可能我之前的表示不是很全面,是这样的:我已经知道是是PD-1这个基因的SNP跟基因有相关性,这个基因大概有100个SNP已经确定的位点,我现在是要检测那些SNP位点跟疾病易感性相关。那该用多少例那?
如果有空,请稍微给俺留两句话,那就感激不胜了。老板催得急,相关文献找的不够有说服力,可把我急坏了。
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我想可能我之前的表示不是很全面,是这样的:我已经知道是是PD-1这个基因的SNP跟基因有相关性,这个基因大概有100个SNP已经确定的位点,我现在是要检测那些SNP位点跟疾病易感性相关。那该用多少例那?
如果有空,请稍微给俺留两句话,那就感激不胜了。老板催得急,相关文献找的不够有说服力,可把我急坏了。
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第一步先用相隔10cM的marker,人类基因组大概是3000cM,所以第一步要用300个样本.
第二步确定一个区域之后,增加分辨率,用1cM的marker,又要用10个.
第三步确定某个区域里的基因,一般也有10个,所以又用10个.
最后确定那个基因是的,还要用northern blot或者转基因技术鉴定,也得10来个吧!
也就300个左右!
这好像是遗传的方法呃...算了,您看着办吧...
第二步确定一个区域之后,增加分辨率,用1cM的marker,又要用10个.
第三步确定某个区域里的基因,一般也有10个,所以又用10个.
最后确定那个基因是的,还要用northern blot或者转基因技术鉴定,也得10来个吧!
也就300个左右!
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