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PCR后DNA跑电泳条带不明显的原因

来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/07/21 01:05:26
PCR后DNA跑电泳条带不明显的原因
PCR后DNA跑电泳条带不明显的原因
问的很模糊呀!下次应该吧具体情况描述清楚,不然很难回答你呀!
条带不明显的意思是由你要的目标条带,但是,条带不亮对吧!那么可以试一下下列办法
1 在反应体系中加入稍为多一些的Mg离子
2 降低反应的温度
3 调整模板量,模板量太多或者太少均得不到很亮的条带.
4 增加循环数!
再问: 谢谢啊,可是为什么要降低反应温度呢。我做的是一个梯度温度,应该跟温度没关系。重新跑了一下竟然什么条带都没有了,这是为什么呢? 我是一学生,加的东西都是老师给的。
再答: 恩! 上面的那四点都是大致的情况,降低温度,增加Mg浓度实际上就是减少PCR产物特异性的!这样可以增加条带亮度! 但是你以前可以扩出条带,现在扩不出来,那么分析可能一下几个原因, 1 你加反应体系的时候出问题了!把反应体系列在旁边的纸上,加一个,打一个勾! 2 当然,上面只是非常特殊的情况,还有一种可能是模板降解了!如果不放心,最好是能换一下! 3 以上两个可能是最应该排除的,之后,可以采用20ul体系中加入1.4-1.5ulMgCl2的方法,扩增35个循环,在看看。同时考察目的片段的GC含量,看看是否需要换成GC buffer 4如果还出不来,那么还可以在调节一下PCR反应条件,适当增加退火时间! 祝好运