生物信息学软件数据库的运用
来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/05 15:14:07
生物信息学软件数据库的运用
老师给了下面序列,让用软件分析,但我不知道这是啥的序列,怎样知道呢?是用NCBI查么?怎么查?
![](http://img.wesiedu.com/upload/e/42/e4253e6e19a88510b846e56234b46247.jpg)
老师给了下面序列,让用软件分析,但我不知道这是啥的序列,怎样知道呢?是用NCBI查么?怎么查?
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![生物信息学软件数据库的运用](/uploads/image/z/298930-58-0.jpg?t=%E7%94%9F%E7%89%A9%E4%BF%A1%E6%81%AF%E5%AD%A6%E8%BD%AF%E4%BB%B6%E6%95%B0%E6%8D%AE%E5%BA%93%E7%9A%84%E8%BF%90%E7%94%A8)
首先可以拿这个序列做blastn和blastx,在NCBI网站上:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi;
根据blastn或者blastx的结果,根据序列比对结果判断这个DNA序列是编码蛋白质的基因还是其他的类型的DNA;
如果是编码蛋白质的基因序列的话,根据blastx结果,可以找到编码区,并获得它编码的氨基酸序列,也可以得到其他一些信息.
如果是非编码区的DNA序列的话,那就根据blastn的比对结果判断这个序列的来源.
根据blastn或者blastx的结果,根据序列比对结果判断这个DNA序列是编码蛋白质的基因还是其他的类型的DNA;
如果是编码蛋白质的基因序列的话,根据blastx结果,可以找到编码区,并获得它编码的氨基酸序列,也可以得到其他一些信息.
如果是非编码区的DNA序列的话,那就根据blastn的比对结果判断这个序列的来源.