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大肠杆菌密码子偏好性现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊?

来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/30 09:39:43
大肠杆菌密码子偏好性
现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊?
大肠杆菌密码子偏好性现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊?
题名[中]: 密码子使用数据库
题名[英]: Codon Usage Database
关键词[中]: 密码子使用表/密码子/物种/使用频率/数据库/基因转录
关键词[英]: Codon Usage Table/Codon/Species/Usage Frequency/Database/Gene Transcription
创建者[英文名]: Ikemura, Toshimichi
创建者地址[英]: Laboratory of Evolutionary Genetics, National Institute of Genetics
出版者[英文名]: Ikemura, Toshimichi
关联.是部分[URI]: http://www.kazusa.or.jp/
资源描述:
密码子使用数据库是CUTG的WWW延伸版本,物种密码子使用频率可以从该网站查询.查询可以通过物种拉丁名或其子字符串搜索.每个物种密码子使用表包括密码子使用的频率(千分比)和每个密码子在物种所有CDS中使用的总数.现在数据库中已包括16591种物种或700501个蛋白编码基因全序列.
我来推荐一个Codon Usage Analyzer(见链接)
其与Codon Usage Database 结合使用,使你的密码优化变得更简单!
http://bioinformatics.org/codon/cgi-bin/codon.cgi